고구마의 수량은 9월 하순까지 거의 결정이 되고 그 이후의  수량 증가는 미미하므로 10월 상·중순까지 수확해야 한다. 
저장을 하거나 전분용으로 이용하기 위해서는 10월 이후 전분가가 높은 시기에 수확하는 것이 좋다. 
고구마는 10℃ 이하의 낮은 온도에 접하면 저장성이나 싹트는 힘이 낮아지므로 서리가 내리기 전까지 수확을 마쳐야 한다.