단감은 수확 가위를 이용해 과실을 하나하나 따는 것이 바람직하다. 운반 시 플라스틱 컨테이너와 같이 단단한 용기를 사용하거나 모노레일로 운반 작업을 할 경우 진동이나 충격에 의한 과실의 압상이 우려되므로 특히 운반에 주의해야 한다.
그 외 태풍피해로 낙엽이 20% 이상인 과원이나 병충해 피해를 심하게 받은 과원의 과실이나 재배 중에 탄저병 등 병해를 입은 과수원의 과실은 저장력이 약하므로 장기저장을 피하는 것이 좋다.