종자용은 알맞은 벼 베기 때보다 약간 빠르게 수확한다. 콤바인으로 벼를 수확할 때는 이슬이 마른 후에 작업을 시작하도록 하고 반드시 수확 기종별로 표준 작업속도를 지키도록 한다.

쓰러진 황숙기 이후의 벼는 물을 빼고 겉잎이 마르면 반대 방향으로 제쳐 줘 수발아를 예방한 다음 서둘러 수확을 하도록 한다. 수확한 벼는 높은 온도에서 말리면 품질이 나빠지므로 일반용은 45℃에서 종자용은 40℃ 이하의 낮은 온도에서 서서히 말리도록 한다.